Con
Mplayer puoi sincronizzare gradualmente l'audio con la semplice pressione dei tasti + e - (cerca proprio Mplayer per Windows).
Oppure puoi provare con VirtualDub ma te lo sconsiglio: se il delay tra audio e video è costante si può fare (per tentativi) altrimenti c'è da impazzire.
Nella prima ipotesi devi aprire il file con VirtualDub e risalvarlo come AVI andando nelle impostazioni (non ricordo se dell'audio o del video) e inserire un ritardo o anticipo in millisecondi, a seconda di quello che ti serve.
E' dura!!! AVGVRI!